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崗位職責(zé) 一、單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析 1、負(fù)責(zé)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組（scRNA-seq）、空間轉(zhuǎn)錄組（spatial transcriptomics）、多組學(xué)整合數(shù)據(jù)的處理與分析，包括數(shù)據(jù)質(zhì)控（QC）、序列比對(duì)、基因表達(dá)定量、細(xì)胞聚類(lèi)、差異表達(dá)分析及功能注釋。 2、構(gòu)建細(xì)胞類(lèi)型注釋流程（如使用SingleR、CellID等工具），完成細(xì)胞亞群鑒定及細(xì)胞發(fā)育軌跡推斷（擬時(shí)序分析）。 3、開(kāi)發(fā)定制化分析腳本（Python/R），支持個(gè)性化研究需求（如細(xì)胞互作網(wǎng)絡(luò)、細(xì)胞狀態(tài)轉(zhuǎn)換模型）。 4、 熟悉單細(xì)胞ATAC和免疫組庫(kù)（TCR/BCR）分析流程。 二、分析流程開(kāi)發(fā)與優(yōu)化 1、搭建和維護(hù)單細(xì)胞測(cè)序分析標(biāo)準(zhǔn)化流程，整合開(kāi)源工具。 2、 優(yōu)化算法參數(shù)，提升數(shù)據(jù)處理效率（如并行計(jì)算、云計(jì)算資源調(diào)度）。 三、生物信息學(xué)工具開(kāi)發(fā) 1、開(kāi)發(fā)自動(dòng)化報(bào)告生成工具，實(shí)現(xiàn)分析結(jié)果可視化（R Shiny、Plotly、Dash）。 2、 構(gòu)建內(nèi)部數(shù)據(jù)庫(kù)，管理單細(xì)胞公共數(shù)據(jù)集（如HCA、Tabula Sapiens）及公司內(nèi)部實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。 四、跨團(tuán)隊(duì)協(xié)作 1、與實(shí)驗(yàn)團(tuán)隊(duì)合作設(shè)計(jì)測(cè)序方案，驗(yàn)證生物信息學(xué)預(yù)測(cè)結(jié)果（如差異基因的qPCR驗(yàn)證）。 2、為臨床或藥研團(tuán)隊(duì)提供數(shù)據(jù)解讀支持，輸出可落地的生物學(xué)洞見(jiàn)。 任職要求 教育背景 生物信息學(xué)、計(jì)算生物學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)或相關(guān)領(lǐng)域本科及以上學(xué)歷（碩士?jī)?yōu)先）。 技術(shù)能力 編程與工具： 精通Python和R語(yǔ)言，熟悉Linux環(huán)境及Shell腳本編程。 熟練使用單細(xì)胞分析工具（Seurat、Scanpy、Cell Ranger、STAR、Salmon）。 熟悉生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)（NCBI、ENA、Single Cell Portal）及常用算法（UMAP、t-SNE、WGCNA）。 數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn)： 至少2年以上單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗(yàn)，完整參與過(guò)至少1個(gè)單細(xì)胞項(xiàng)目（從原始數(shù)據(jù)到生物學(xué)結(jié)論）。 熟悉單細(xì)胞數(shù)據(jù)降噪、批次校正（Harmony、BBKNN）及細(xì)胞通訊分析（CellPhoneDB、CellChat）。 加分項(xiàng)： 有多組學(xué)（scRNA+ATAC/CITE-seq）整合分析經(jīng)驗(yàn)。 熟悉云計(jì)算平臺(tái)（AWS、阿里云）及容器化技術(shù)（Docker/Singularity）。 有算法開(kāi)發(fā)經(jīng)驗(yàn)（如自定義聚類(lèi)算法或軌跡推斷模型）。 其他要求 具備快速學(xué)習(xí)能力，能獨(dú)立跟蹤領(lǐng)域前沿技術(shù)（如空間多組學(xué)、機(jī)器學(xué)習(xí)驅(qū)動(dòng)的細(xì)胞注釋?zhuān)?良好的跨學(xué)科溝通能力，能將復(fù)雜分析結(jié)果轉(zhuǎn)化為可理解的生物學(xué)結(jié)論。 英語(yǔ)熟練，能高效閱讀文獻(xiàn)及技術(shù)文檔。 優(yōu)先考慮條件 1、在國(guó)際期刊發(fā)表過(guò)單細(xì)胞相關(guān)論文。 2、有藥物研發(fā)背景（如腫瘤微環(huán)境解析、免疫細(xì)胞圖譜構(gòu)建）。 3、熟悉FDA/EMA的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)提交規(guī)范（如FAIR原則）。