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崗位職責(zé)

1. 蛋白功能位點(diǎn)與關(guān)鍵殘基分析
深入分析蛋白的結(jié)構(gòu) (X-ray、Cryo-EM模型)，利用生物信息學(xué)工具 (序列比對(duì)、進(jìn)化分析、結(jié)構(gòu)預(yù)測工具如AlphaFold、PyMOL、Chimera等) 預(yù)測潛在的受體結(jié)合域和關(guān)鍵識(shí)別位點(diǎn)
2. 理性突變設(shè)計(jì)與文庫規(guī)劃
基于結(jié)構(gòu)信息、能量計(jì)算 (如分子對(duì)接、MD模擬結(jié)果) 和功能預(yù)測，理性設(shè)計(jì)針對(duì)關(guān)鍵識(shí)別位點(diǎn)的特異性突變 (飽和突變、特定組合突變等)，針對(duì)選定的關(guān)鍵區(qū)域 (熱點(diǎn)區(qū)域) 設(shè)計(jì)構(gòu)建聚焦型突變文庫。評(píng)估突變對(duì)蛋白結(jié)構(gòu)和功能可能產(chǎn)生的影響。

任職要求
1. 生命科學(xué)相關(guān)專業(yè) (分子生物學(xué)、生物化學(xué)、結(jié)構(gòu)生物學(xué)、生物信息學(xué)、生物工程等) 碩士學(xué)位。
2. 精通多序列比對(duì) (Clustal Omega、MUSCLE等)、系統(tǒng)發(fā)育分析、保守區(qū)域和熱點(diǎn)位點(diǎn)識(shí)別。熟練使用蛋白結(jié)構(gòu)可視化軟件 (如PyMOL、UCSF Chimera、ChimeraX)，理解PDB文件內(nèi)容，能進(jìn)行基本的結(jié)構(gòu)分析 (如表面電荷分布、親疏水性、B因子、氫鍵網(wǎng)絡(luò)分析)。具備蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測 (如AlphaFold2) 模型分析和解讀能力。
3. 有使用分子對(duì)接軟件 (如HADDOCK、RosettaDock) 或分子動(dòng)力學(xué) (MD) 模擬軟件 (如Gromacs、AMBER) 進(jìn)行蛋白-蛋白相互作用研究的經(jīng)驗(yàn)優(yōu)先。
4. 有參與過蛋白質(zhì)定向進(jìn)化 (如噬菌體展示、酵母展示文庫篩選) 或細(xì)胞表面展示文庫篩選的經(jīng)驗(yàn)優(yōu)先。